Regimen Geberal y R.E mismo sujeto

[Ignacio]

Una carnicería vende pollos frescos comprados al matadero sin añadir ninguna operación que signifique transformación, por lo tanto estimo que debe incluirse en el Régimen especial de Recargo de equivalencia.
Simultáneamente ha montado otra actividad que es la de asador de pollos, Estos pollos asados se venden al consumidor final, por lo tanto estimo que no siendo comercio minorista y habiendo sufrido una transformación debería incluirse la actividad en Régimen General.
Ahora bien, el matadero que le vende los pollos ¿que forma tiene de saber cuando va a una actividad o a otra?No lo sabe ni la propia carnicería-asador Siendo el producto el mismo, no hay forma de saber de antemano cuando van a afectar a una actividad o a otra.
¿Cómo debería facturar el matadero cada vez que dicho cliente le pide pollos?¿con R.E. o sin él?
Y otra cosa el cliente, es decir la carnicería -asador tendría que estar matriculado en dos epígrafes distintos en el IAE?
¿?de quién será la responsabilidad de aplicar el Iva correctamente? ¿Basta con que el cliente lo manifieste así?
Gracias a todos.