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Queria consultar los intereses de demora de hacienda a que cuenta de gastos los llevos? ya que no es como un gasto bancario la 669.
y a la hora de hacer una factura a un cliente se el cobra el transporte de la agencia que posteriormente dicha agencia me pasa su factura correspondiente. Ese incremento en nuestra factura de comprar a que cuenta de ingresos lo llevo ya que no es una venta.

Los cargos por intereses aplicados por la AEAT, no dejan de ser "gastos financieros". Por lo tanto la cuenta idónea en la 669-Otros gastos financieros.
Por lo que respecta a los transportes repercutidos a los clientes ( por otra parte atendidos de pago por vosotros al transportista), no hay regla única para reflejarlos en la contabilidad. Cada cual puede actuar según su criterio, optando por cualesquiera de las siguientes opciones:

1)-Dejarlos incluidos como mayor ingreso por ventas ( 70x).
2)-Abonarlos bien en la 705-Prestación de servicios, o en una exprofeso dada en alta en el sub-grupo 75-Otros ingresos de gestión (755-Transportes repercutidos a clientes, por ejemplo).En tal caso quizá mejor esta segunda opción, ya que como servicio físico en base a vuestros propios recursos, no existe como tal.
3)-Llevarlos en abono a la 624-Transportes que es la cuenta en que se soportará la factura de vuestro transportista. De tal manera el saldo de la 624 reflejará solo aquellos importes de transporte neto a vuestro cargo. Valga decir que en tal caso, en contrapartida de la transparencia resultante del saldo de la 624, se crea un desplazamiento de algo que siendo facturación, no queda reflejado en las cuentas del Grupo 7-Ventas e ingresos.

Muchas gracias por la ayuda