Cuota impuesto sociedades 202

[José 1976]

He llegado recientemente a una empresa donde se me presenta el siguiente caso:

Durante el ejercicio 2017 la sociedad tenía que haber realizado pagos a cuenta del impuesto de sociedades que se presento en Julio del 2018.
Dicha sociedad no los hizo y ha sido la agencia tributaria la que ha mandado estas liquidaciones a posteriori una vez cerrado y presentado en el ejercicio 2017.
Estas liquidaciones han venido con su correspondiente sanción. Pero mi pregunta es la siguiente:
Estos pagos a cuenta deberían haberse deducido al presentar el impuesto de sociedades en términos normales, pero como ya os he dicho las liquidaciones de la agencia tributaria ha venido a posteriori de presentar el impuesto.
Entonces, ¿donde y como debo reflejar esta cantidad no deducida anteriormente en la contabilidad y como aplicarla al impuesto de sociedades?.
¿Se pueden incluir estas cuotas cuando presente el impuesto de sociedades del 2018 junto con los pagos a cuenta del ejercicio 2018?
Gracias